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Information

Ingénieur en développement logiciel pour la génomique microbienne-plateforme MicroScope H/F

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Détail de l'offre

Informations générales

CEA (logo)

Entité de rattachement

Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.

Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un socle de recherche fondamentale. Le CEA s'engage depuis plus de 75 ans au service de la souveraineté scientifique, technologique et industrielle de la France et de l'Europe pour un présent et un avenir mieux maîtrisés et plus sûrs.

Implanté au cœur des territoires équipés de très grandes infrastructures de recherche, le CEA dispose d'un large éventail de partenaires académiques et industriels en France, en Europe et à l'international.

Les 20 000 collaboratrices et collaborateurs du CEA partagent trois valeurs fondamentales :

• La conscience des responsabilités
• La coopération
• La curiosité
  

Référence

2025-36340  

Description de la Direction

La Direction de la Recherche Fondamentale (DRF) du CEA regroupe plus de 5000 personnes sur les sites de Cadarache, Grenoble, Marcoule et Paris-Saclay. Elle conduit des recherches en sciences physiques, chimiques, biologiques et environnementales, en s'appuyant sur des technologies et des instruments de pointe

Description de l'unité

Implanté au sein du Genoscope à Évry, le Laboratoire d'Analyses Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme (LABGeM) s'inscrit pleinement dans la stratégie de développement de la bioinformatique au sein de l'Institut JACOB. Le laboratoire participe activement au projet MUDIS4LS, une initiative nationale ambitieuse visant à structurer des infrastructures numériques mutualisées pour les sciences du vivant.
En combinant expertises en génomique, analyse comparative et développement logiciel, le LABGeM développe la plateforme MicroScope, un outil de référence pour l'annotation et l'exploration des génomes procaryotes. Grâce à ses technologies innovantes et à une communauté internationale de plus de 7 000 utilisateurs, le laboratoire contribue à faire progresser la compréhension de la diversité microbienne et des fonctions métaboliques, au service de la recherche fondamentale et appliquée.

Description du poste

Domaine

Systèmes d'information

Contrat

CDI

Intitulé de l'offre

Ingénieur en développement logiciel pour la génomique microbienne-plateforme MicroScope H/F

Statut du poste

Cadre

Description de l'offre

Vous êtes passionné(e) par la bioinformatique, l'innovation technologique et le développement logiciel au service de la recherche en génomique ? Rejoignez une équipe dynamique au cœur des enjeux scientifiques d’aujourd’hui et de demain.

Afin de relever les nouveaux défis et d'assurer le maintien de la plateforme MicroScope à la pointe de la technologie, nous recherchons un(e) ingénieur(e) de recherche pour piloter les développements informatiques en étroite collaboration avec les responsables scientifiques de la plateforme.

En collaboration avec les ingénieurs de l’équipe, vous êtes en charge de l’analyse, du développement, de l’intégration et du déploiement des solutions logicielles, en coopération avec le laboratoire d’informatique scientifique du Genoscope.

Ces activités s'inscrivent notamment dans le cadre du projet MUDIS4LS, qui bénéficie d’un financement pour le renouvellement de l’infrastructure, mais également dans un contexte plus large visant à promouvoir des initiatives communes au niveau national et européen dans les domaines de la bioinformatique et de la génomique.

Vos principales missions :

  • Vous orientez et coordonnez les activités de développement logiciel dans le cadre de la plateforme MicroScope.
  • Vous mettez en place des solutions innovantes (modèle de données, algorithmes) pour répondre aux challenges technologiques d'annotation et de comparaison de millions de génomes.
  • Vous participez au développement de nouvelles méthodes bioinformatiques avec les chercheurs de l'équipe.
  • Vous participez aux choix d'infrastructure informatique et à leur validation pour la mise en œuvre des solutions.

Profil du candidat

Vous êtes titulaire d'un Master ou Doctorat en informatique ou bioinformatique, avec une expertise marquée en développement et disposant de compétences dans les domaines suivants :

  • Conception et le développement d'applications à architecture multi-tiers : base de données, système de production (workflow/HTC), interface utilisateur Web.
  • Management et gestion de projets logiciels.
  • Modélisation et programmation objet (python).
  • Parallélisation de calculs sur systèmes HTC.
  • Systèmes d'exploitation Linux/Unix et langages de script.

Des compétences supplémentaires dans les domaines ci-dessous sont souhaitées :

  • Le développement de méthodes de traitement de données massives.
  • Déploiement d'applications suivant le modèle DevOps.

Votre profil demande également :

  • des aptitudes dans l’animation d’une équipe et la planification/gestion de tâches.
  • Une bonne capacité de communication orale et écrite (anglais et français) est indispensable.
  • Des notions en génomique et microbiologie seraient un plus.

Pourquoi nous rejoindre ?

  • Vous intégrez un environnement de recherche innovant, dédié aux enjeux majeurs en biologie et en santé.
  • Vous bénéficiez de formations pour renforcer vos compétences et faire évoluer votre carrière.
  • Vous profitez d’un équilibre vie privée/vie professionnelle facilité par des dispositifs adaptés.
  • Vous accédez à un CE proposant de nombreux avantages sociaux, culturels et sportifs.
  • Vous bénéficiez d’avantages pratiques : télétravail, transport pris en charge à 75%.

Vous souhaitez faire partie de l’aventure ?

Postulez dès maintenant en envoyant votre CV et lettre de motivation à : acalteau@genoscope.cns.fr, vallenet@genoscope.cns.fr

Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l'inclusion des travailleurs handicapés.

Localisation du poste

Site

Autre

Localisation du poste

France, Ile-de-France, Essonne (91)

Ville

EVRY

Critères candidat

Formation recommandée

BAC+5

Demandeur

Disponibilité du poste

01/09/2025


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