Informations générales
Entité de rattachement
Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.
Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un socle de recherche fondamentale. Le CEA s'engage depuis plus de 75 ans au service de la souveraineté scientifique, technologique et industrielle de la France et de l'Europe pour un présent et un avenir mieux maîtrisés et plus sûrs.
Implanté au cœur des territoires équipés de très grandes infrastructures de recherche, le CEA dispose d'un large éventail de partenaires académiques et industriels en France, en Europe et à l'international.
Les 20 000 collaboratrices et collaborateurs du CEA partagent trois valeurs fondamentales :
• La conscience des responsabilités
• La coopération
• La curiosité
Référence
2026-39845
Description de la Direction
La Direction de la Recherche Fondamentale (DRF) du CEA réunit plus de 5000 personnes sur quatre sites et mène des recherches en sciences physiques, chimiques, biologiques et environnementales, en utilisant des technologies de pointe.
Description de l'unité
Implanté sur le site d'Évry, l'Institut JACOB s'inscrit pleinement dans la stratégie scientifique de la DRF, en participant activement au projet PanGaimix qui vise à exploiter l'intelligence artificielle pour améliorer la microbiologie computationnelle à grande échelle à l'aide de graphes de pangénomes, nous recrutons un(e) ingénieur(e) pour rejoindre notre équipe et contribuer au développement de PPanGGOLiN afin de permettre des analyses au niveau du genre.
Description du poste
Domaine
Biologie, biophysique et biochimie
Contrat
CDD
Intitulé de l'offre
Ingénieur pour le développement de nouvelles méthodes en pangénomique H/F
Statut du poste
Cadre
Durée du contrat (en mois)
35
Description de l'offre
Vous contribuerez à améliorer le modèle et les méthodes de PPanGGOLiN afin de permettre des analyses de pangénomes au niveau du genre, tout en conservant le niveau de détail au niveau de l’espèce.
Les principaux objectifs seront :
· Adapter le modèle de données de PPanGGOLiN et les familles de gènes à différents niveaux taxonomiques, notamment espèce et genre.
· Améliorer la méthode de partitionnement NEM (Neighborhood Expectation‑Maximization) implémentée dans PPanGGOLiN.
· Mettre à jour les méthodes panRGP et panModule pour les adapter au nouveau modèle de données, avec un ajustement des paramètres afin de prendre en compte la diversité génomique accrue au niveau du genre.
Profil du candidat
· Master en bioinformatique ou en informatique
· Expertise en algorithmes de bioinformatique (graphes) et en développement logiciel
· Solides compétences en programmation Python ; une expérience en développement C serait également appréciée
· Des connaissances en génomique microbienne et en statistiques seraient un plus
Localisation du poste
Site
Fontenay-aux-Roses
Localisation du poste
France, Ile-de-France, Essonne (91)
Ville
EVRY
Critères candidat
Formation recommandée
Master en bioinformatique ou en informatique
Demandeur
Disponibilité du poste
04/05/2026
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