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    <title>RSS export of vacancies - Seulement les offres à la une : No / Profil : Sciences du vivant, Sûreté nucléaire / Contrat : CDD</title>
    <link>https://cea-recrute.talent-soft.com/handlers/offerRss.ashx?Rss_JobDescription_Contract=578&amp;Rss_Profile=1922%2C1917&amp;lcid=2057</link>
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    <language>en-GB</language>
    <item>
      <link>https://www.emploi.cea.fr/Pages/Offre/detailoffre.aspx?idOffre=40283&amp;idOrigine=502&amp;LCID=2057&amp;offerReference=2026-40283</link>
      <category>Life Sciences</category>
      <category>Fixed-term contract</category>
      <category>Evry </category>
      <title>2026-40283 - Post-doc en biologie cutanée et exposome H/F</title>
      <description>&lt;b&gt;Category : &lt;/b&gt;Life Sciences&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Contract : &lt;/b&gt;Fixed-term contract&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Position description : &lt;/b&gt;&lt;br /&gt;
Intitulé du projet : Perturbations cutanées induites par l’exposome : recherche de signatures moléculaires et d’effecteurs, exploration d’une approche corrective.
La fonction première de la peau est de constituer une barrière physique entre le corps et l'environnement extérieur, le protégeant ainsi des agents pathogènes, des facteurs toxiques et de la déshydratation. Différents stress de l’exposome peuvent altérer son intégrité, notamment les rayonnements ionisants (radiothérapie) et solaires, entraînant respectivement le développement de fibrose et la mise en place d’une élastose. Ce projet s’intéresse à deux composants de ces processus physiopathologiques : les modifications des fibroblastes dermiques et les désorganisations matricielles affectant la structure et la fonctionnalité du derme.
Un premier versant du projet portera sur la compréhension de la reprogrammation conduisant aux transformations pathologiques du derme. Il s’appuie sur l’accès à des cellules et échantillons de peau humaine représentatifs d’états sains et perturbés. Ce matériel sera mis à profit pour la réalisation de profilages moléculaires ‘multi-Omics’ sur cellules, ainsi que pour des analyses spatiales sur tissus.
Un second versant portera sur l’obtention d’une répression de caractères associés aux désorganisations dermiques. L’approche aura pour principe la vectorisation d’ARNs actifs ciblant des effecteurs de ces désorganisations. L’objectivation fonctionnelle bénéficiera de l’accès à des modèles cellulaires et organoïdes générés à partis de cellules primaires de peau humaine.
Vous travaillerez au sein du Laboratoire de Régénération et Radiopathologies Cutanées’ (LR2C), laboratoire porteur du projet, situé au sein du biocluster Évry-Génopole.

Vos missions
Vous bénéficierez d’un environnement multidisciplinaire pour mener à bien vos missions
Préparation de sous-populations de cellules primaires extraites d’échantillons de peau humaine, sélectionnées selon différents caractères phénotypiques et fonctionnels (présence sur site d’une plate-forme de tri par cytométrie en flux).
Réalisation de profilages moléculaires ‘multi-Omics’ (compétences en bio-statistique et bio-analyse présentes en interne).
Mise en œuvre de modèles fonctionnels ex vivo (cultures 2D et organoïdes cutanés 3D).
Travail de synthèse inhérent au suivi du programme (rapports, réunions)
Rédaction de publications.&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
Votre profil 
Vous êtes titulaire d’une thèse dans le domaine biomédical.
Compétences techniques et comportementales
Compétences en génomique fonctionnelle (RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATC-seq, etc.)
Connaissances en biologie cutanée et/ou biomécanique
Culture cellulaire 2D (cellules primaires humaines) et expertise sur organoïdes 3D.
Cytometries en flux, RT-PCR, méthodes d’imagerie.
Travail d'équipe, autonomie, capacité à travailler dans un environnement multidisciplinaire.
Pourquoi nous rejoindre ? ….
En rejoignant l'Institut JACOB, vous intégrez un environnement de recherche dynamique et innovant où vous avez l’opportunité d’apprendre, de grandir et de jouer un rôle clé au sein d’une entité/unité d’excellence.
…ET CE N’EST PAS TOUT !
Les à-côtés de votre mission principale peuvent vous intéresser :
Un écosystème de recherche à la pointe, dédié à des thématiques à fort enjeu sociétal.
Des formations pour renforcer vos compétences et booster votre carrière.
Un équilibre vie privée/vie professionnelle reconnu
Un CE riche en avantages sociaux, culturels et sportifs.
Des avantages pratiques : tickets restaurant, transport pris en charge à 75%, , et bien plus encore.
Un cadre de travail à deux pas du Campus d’Evry (Université Paris-Saclay), au cœur de la recherche en génomique en France.

Vous souhaitez faire partie de l’aventure ? Postulez dès maintenant et mettez votre énergie au service de la recherche et de l’innovation ! Envoyé votre CV à Nicolas FORTUNEL nicolas.fortunel@cea.fr
Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l'inclusion des travailleurs handicapés&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Location : &lt;/b&gt;Evry &lt;br /&gt;
</description>
      <pubDate>Fri, 04 Sep 2026 22:10:28 Z</pubDate>
    </item>
    <item>
      <link>https://www.emploi.cea.fr/Pages/Offre/detailoffre.aspx?idOffre=40977&amp;idOrigine=502&amp;LCID=2057&amp;offerReference=2026-40977</link>
      <category>Life Sciences</category>
      <category>Fixed-term contract</category>
      <category>Saint Paul Lès Durance</category>
      <title>2026-40977 - Technicien en mesures physiques H/F</title>
      <description>&lt;b&gt;Category : &lt;/b&gt;Life Sciences&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Contract : &lt;/b&gt;Fixed-term contract&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Position description : &lt;/b&gt;&lt;br /&gt;
Dans le cadre d'un surcroit d'activité, en votre qualité de technicien.ne en mesures physiques, vous travaillerez au sein du laboratoire de biologie du CEA de Cadarache en collaboration avec le Service de Prévention de la Santé au travail dans le cadre de la surveillance médicale des salariés.
La surveillance médicale des travailleurs implique la réalisation d’examens médicaux relevant de l’accréditation Cofrac 15189 (examens de biologie médicale et examens de radiotoxicologie), ainsi que des examens relevant de l’accréditation Cofrac 17025 (Anthroporadiométrie)
Rattaché(e) au Biologiste Responsable et au Chef de service du LBM hiérarchiquement au chef de service et techniquement au Biologiste Responsable du LABM, vous serez intégré(e) au sein d'un groupe de 13 personnes (3 biologistes, 8 techniciens, 1 aide-technique, 1 secrétaire gestionnaire) et serez sera en charge des missions suivantes :
 Activités d’Anthroradiométrie : 
o    Réalisation des examens de spectrométrie In-Vivo Gamma X selon une géométrie corps entier, poumons ou plaie
o    Détection et quantification de rayonnements X/Gamma émis par des radionucléides présents dans l’organisme
o    Suivi systématique et Suivi incidentel
o    Etalonnage des détecteurs (Energie, Efficacité)
o    Paramétrage / Réglages des chaines de mesures
o    Participation aux comparaisons inter-laboratoires

Gestion des équipements en Anthroporadiométrie et en Radiotoxicologie :
o    Maintenance des chaînes de mesure et raccordement métrologique

Activités de Radiotoxicologie :
o    Détection et Mesure de la radioactivité α ou β par comptage de prélèvements narinaires via un compteur proportionnel dans le cadre d’un suivi en systématique ou incident

Activités de Qualité : 
o   Participation à la revue/ révision des documents qualité pour le maintien des accréditations Cofrac, en lien avec le Responsable Qualité

&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
Vous disposez d’un diplôme de technicien en mesures physiques (BUT, BTS) ou d’un diplôme équivalent. Vous possédez des compétences en informatique ou en micro-électronique, et vous maîtrisez ou connaissez les outils d’analyse tels que Python ou Scilab. La connaissance des logiciels APEX Mirion serait un atout pour ce poste.
Vous êtes organisé.e et rigoureux.se, autonome tout en ayant un bon esprit d’équipe. Vous savez respecter la confidentialité et vous faites preuve de curiosité, d’esprit critique et de capacité d’anticipation dans vos analyses et synthèses.
&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Location : &lt;/b&gt;Saint Paul Lès Durance&lt;br /&gt;
</description>
      <pubDate>Thu, 03 Sep 2026 22:12:53 Z</pubDate>
    </item>
    <item>
      <link>https://www.emploi.cea.fr/Pages/Offre/detailoffre.aspx?idOffre=40231&amp;idOrigine=502&amp;LCID=2057&amp;offerReference=2026-40231</link>
      <category>Nuclear safety</category>
      <category>Fixed-term contract</category>
      <category>Fontenay-Aux-Roses</category>
      <title>2026-40231 - CDD 36 mois - Ingénieur.e Gestion de configuration </title>
      <description>&lt;b&gt;Category : &lt;/b&gt;Nuclear safety&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Contract : &lt;/b&gt;Fixed-term contract&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Position description : &lt;/b&gt;&lt;br /&gt;
Dans le cadre de l’assainissement et du démantèlement de l'INB 165 dite INB « Procédé » et de l'INB 166 dite INB « support », il est nécessaire d’assurer le Maintien en Conditions Opérationnelles et Sûres (MCOS) des INB.

Intégré.e au Laboratoire d'Exploitation et de Maintenance des INB en Démantèlement (LEMID) et sous l'autorité de la cheffe de laboratoire, vous serez amené.e à travailler en étroite collaboration avec :

Les collaborateurs du LEMID 🤝

Les collaborateurs du Laboratoire Travaux et Jouvence des Installations en Démantèlement (2e laboratoire du service SEID),

les ingénieurs projets, responsables de lot et chefs de projets,

les ingénieurs du GEM (Groupe Exploitation Maintenance) et du GTI (Groupe Travaux et Ingénierie) du DSST.

Vous serez en charge de la mise en place et du pilotage d’un contrat pluriannuel d’assistance à la gestion de configuration assurant :

🎯  La gestion des demandes d’évolutions

🎯  Les analyses d’impact des modifications (techniques, documentaire)

🎯  Les implémentations dans les plans et documents ad hoc (y compris GMAO). Un effort particulier devra être porté à la mise à jour des plans de GC, des schémas électriques, des systèmes fluides (mise à jour et archivage).

Vous serez responsable de l'ensemble des activités de gestion de configuration :

🎯 en interaction avec les parties prenantes : équipes travaux (SEID et DSST), équipes projet de démantèlement, ingénieurs sûreté/sécurité, équipes maintenance (SEID et DSST).

🎯 vous mettez en place le socle documentaire UADF associé à la gestion de configuration (plans de management, procédures et guides méthodologiques ; mise à jour régulière de ce référentiel)

🎯 vous mettez en place une organisation associée à la gestion de configuration (comité de configuration, comptes rendus associés et suivi des actions qui en découlent).
 
Vous serez nommé.e référent.e maintenance projet, permettant ainsi d’anticiper les impacts des chantiers sur le fonctionnement des INB comme pour préparer la prise en main des nouveaux équipements par l’exploitant.
 
Vous établirez un reporting régulier de vos activités.&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
PARLONS DE VOUS !


🏆 Vous êtes diplômé.e d’école d’ingénieurs ou d’un master 2 avec une spécialisation dans le domaine du nucléaire et/ou dans la maintenance industrielle.

Vous disposez d’une première expérience significative dans l’un de ces deux domaines.

Vous disposez d’une solide et significative expérience en pilotage contractuel et financier de contrat.

Une expérience réussie dans le domaine de la sûreté et/ou de la sécurité dans le domaine nucléaire sera appréciée.

Une connaissance de la GMAO INFOR EAM serait un plus.

Vous être particulièrement rigoureux.se et proactif.ve. 💼

Vous savez faire preuve d’autonomie et avez l’esprit d’analyse et de synthèse.

Vous êtes force de proposition et savez prendre des initiatives.



PARLONS DE NOUS !

Nous vous proposons un poste au cœur de Fontenay-Aux-Roses, facilement accessible via la mobilité douce favorisée par le CEA (participation aux transports en commun à hauteur de 75%) 🚆

Nous vous proposons un équilibre vie privée – vie professionnelle reconnu (Accord d’entreprise sur la qualité de vie au travail)

Nous vous proposons un restaurant d'entreprise 🍽️

Nous vous proposons un comité d'entreprise actif 🎉 en termes de loisirs et d'activités extra-professionnelles

Nous vous proposons un ancrage dans l'écosystème local qui vous ouvrira un réseau professionnel diversifié et dynamique.


"Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des
aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l’inclusion des travailleurs handicapés"&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Location : &lt;/b&gt;Fontenay-Aux-Roses&lt;br /&gt;
</description>
      <pubDate>Wed, 02 Sep 2026 07:24:35 Z</pubDate>
    </item>
    <item>
      <link>https://www.emploi.cea.fr/Pages/Offre/detailoffre.aspx?idOffre=40215&amp;idOrigine=502&amp;LCID=2057&amp;offerReference=2026-40215</link>
      <category>Nuclear safety</category>
      <category>Fixed-term contract</category>
      <category>  Saint-Paul-Lez-Durance</category>
      <title>2026-40215 - Ingénieur sûreté chantier - CDD 18 mois - Cadarache F/H</title>
      <description>&lt;b&gt;Category : &lt;/b&gt;Nuclear safety&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Contract : &lt;/b&gt;Fixed-term contract&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Position description : &lt;/b&gt;&lt;br /&gt;
« Rejoignez le CEA pour donner du sens à votre activité, mener ou soutenir des projets de R&amp;D nationaux et internationaux, cultiver et faire vivre votre esprit de curiosité. »
EN SYNTHESE, QU’EST-CE QUE NOUS VOUS PROPOSONS ?
Nous cherchons un(e) Ingénieur(e) sûreté chantier pour la DES (Direction des ÉnergieS) du CEA. Ce poste de cadre en CDD (18 mois) est basé sur le site de Cadarache (13).

Ce poste est à pourvoir à partir du 01/07/2026.

QU’ATTENDONS-NOUS DE VOUS ?
Le poste consiste à assurer les fonctions d'Ingénieur Sûreté (ISU) de l'INB notamment en lien avec les projets de rénovation et jouvence (chantier renforcement séisme, jouvence incendie, réexamens,...).
En tant qu'Ingénieur sûreté INB, vous êtes en charge des activités transverses et régaliennes de sûreté suivantes :
le conseil du Chef d'Installation, accompagnement de l'exploitant et des expérimentateurs sur la sûreté,
l'instruction des demandes de modification d'installation
l'élaboration des demandes d'autorisation (dossiers de sûreté soumis au Directeur de Centre ou à l'Autorité de Sûreté)
la définition des dispositions opérationnelles de maîtrise des risques (analyse de risque)
la mise à jour des référentiels de sûreté (Rapport de Sûreté et Règles Générales d'Exploitation),
la rédaction/vérification des documents applicables sur le terrain (documents opérationnels de type consigne, fiche réflexe,...)
la mise en œuvre des dispositions de sûreté et déploiement sur le terrain, évaluation et le contrôle des dispositions de maîtrise des risques (contrôles de terrain et interviews notamment d’AIP)
la gestion des écarts et évènements (FEA, ES) relatifs à la sûreté de l'installation, rédaction de déclaration, l'analyse des causes, rédaction de compte-rendu et retour d'expérience des FEA, suivi des actions correctives et préventives,
la préparation et participation aux éléments de réponses aux demandes formulées (par l'ASNR ou de la Direction du Centre) dans le cadre d'inspection de dossiers
l'analyse de notes d’instruction, des guides et recommandations (DSSN, CQSE, CSMN, …) et leur déclinaison
la rédaction de bilans (bilan annuel de sûreté de l'installation, retour d'expérience, étude du vieillissement d’équipements)

En tant qu'Ingénieur sûreté chantier, vous avez pour missions :
la collecte des données d'entrée, l'analyse des demandes de modifications/d'interventions, la vérification des cahiers des charges, des notes d'études, des documents opérationnels et LOMC
le suivi des prérequis nécessaires à la réalisation des opérations, participation aux points de rencontre et d'arrêt
l'élaboration, le suivi, la vérification et la collecte d'éléments attestant de la bonne réalisation, contrôle technique et capitalisation du rex des actions de surveillance
la mise à jour de documents opérationnels d'exploitation et de maintenance (gammes, inventaire, mode opératoire, procédure, …)&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
COMPÉTENCES REQUISES :
Formation : Titulaire d'un Bac+5 (Master ou diplôme d'Ingénieurs spécialisé dans le domaine du nucléaire). 
Expérience : Vous disposez d'une expérience professionnelle de 3 à 5 ans
Vous disposez des savoir-faire scientifiques et techniques en analyses de sûreté, maîtrise des intervenants extérieurs, maîtrise des risques, exploitation des conclusions d'études, solutions techniques et/ou organisationnelles
Vous maitrisez les méthodes d'analyse de sûreté, la règlementation française en
matière de sûreté nucléaire (notamment l'arrêté INB).
Une expérience en INB est souhaitable
La connaissance des risque facteur humain et organisationnel est un plus.
Qualité personnelles :Vous vous adaptez avec agilité à des environnements évolutifs et diversifiés (méthodes, organisation, interlocuteurs).
Vous analysez les situations avec pertinence, en formulant des propositions constructives pour améliorer le fonctionnement.
Vous faites preuve de rigueur, en appliquant les règles et procédures de votre environnement de travail.
Vous êtes autonome et responsable, capable de prendre en charge et de mener à bien les actions confiées.
Vous communiquez avec clarté, en assurant un reporting régulier et structuré auprès de votre hiérarchie et de vos collaborateurs.
Vous êtes réactif(ve) et fiable, capable de gérer efficacement les imprévus tout en respectant les délais.
Vous êtes à l’écoute et pédagogue, en diffusant et partageant l’information de manière claire et adaptée à vos interlocuteurs.
 
VOUS AVEZ ENCORE UN DOUTE ?
Les à-côtés de votre mission principale peuvent nous intéresser :
Un écosystème de recherche à la pointe, unique en son genre et dédié à des thématiques à fort enjeu sociétal, qui donne du sens à votre mission
Des formations pour renforcer vos compétences, en acquérir de nouvelles, booster votre mission et bénéficier de perspectives de carrière avec plus de 60 familles de métier
Un équilibre vie privée / vie professionnelle reconnu par nos collaborateurs
Un CE riche en avantages et en activités sociales, culturelles et sportives
Un lieu de travail au cœur d’un écrin de nature

Cela vous tente ? Postulez, ce poste est fait pour vous !
Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l'inclusion des travailleurs handicapés.&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Location : &lt;/b&gt;  Saint-Paul-Lez-Durance&lt;br /&gt;
</description>
      <pubDate>Mon, 27 Jul 2026 08:33:30 Z</pubDate>
    </item>
    <item>
      <link>https://www.emploi.cea.fr/Pages/Offre/detailoffre.aspx?idOffre=40488&amp;idOrigine=502&amp;LCID=2057&amp;offerReference=2026-40488</link>
      <category>Life Sciences</category>
      <category>Fixed-term contract</category>
      <category>Marcoule</category>
      <title>2026-40488 - Chercheur post-doctoral en protéomique H/F </title>
      <description>&lt;b&gt;Category : &lt;/b&gt;Life Sciences&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Contract : &lt;/b&gt;Fixed-term contract&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Position description : &lt;/b&gt;&lt;br /&gt;
Vous êtes passionné par la protéomique et souhaitez contribuer à l’amélioration des tests de diagnostic, essentiels pour la santé ?
Rejoignez nous en tant que jeune chercheur spécialiste en protéomique et en recherche de biomarqueurs, dans le cadre d’un projet européen, au sein du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D).

Vos missions seront :
Développement et optimisation des protocoles de préparation d’échantillons,

Analyse et interprétation des données pour l’identification de peptides signatures,

Évaluation des performances analytiques (sensibilité, spécificité, robustesse),

Mise en œuvre de méthodes LC-MS/MS pour le protéotypage rapide,

Rédaction de rapports et contributions aux publications et communications scientifiques,

Implication dans les activités générales de la plateforme (soutien méthodologique, participation à d’autres projets, opérations transverses).&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
Votre profil :

Vous êtes titulaire d'un doctorat en protéomique, spectrométrie de masse, biochimie, ou biotechnologies.

 Compétences techniques et comportementales :

Vous avez une expérience confirmée en LC-MS/MS et des connaissances en cellule unique ou compétences en analyse bio-informatique, des connaissances en microbiologie (travail en P2 serait un plus).

Vous êtes capable de travailler en autonomie et en collaboration dans un environnement international et disposez d’un excellent niveau de communication écrite et orale, avec un anglais professionnel requis.

Pourquoi nous rejoindre ?

En rejoignant le Li2D, vous intégrez un environnement de recherche dynamique et innovant où vous avez l’opportunité d’apprendre, de progresser, et de jouer un rôle clé au sein d’une unité de recherche d’excellence.

…ET CE N’EST PAS TOUT !
Les à-côtés de votre mission principale peuvent vous intéresser :
Un écosystème de recherche à la pointe, dédié à des thématiques à fort enjeu sociétal.
Des formations pour renforcer vos compétences et booster votre carrière.
Un équilibre vie privée/vie professionnelle reconnu.
Un CE riche en avantages sociaux, culturels et sportifs.
Des avantages pratiques : restaurant d’entreprise, transport pris en charge à 75% et bien plus encore.
Vous souhaitez faire partie de l’aventure ? Postulez dès maintenant et mettez votre énergie au service de la recherche et de l’innovation !
Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l'inclusion des travailleurs handicapés.&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Location : &lt;/b&gt;Marcoule&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Language / Level : &lt;/b&gt;&lt;br /&gt;
English : Fluent&lt;br /&gt;
</description>
      <pubDate>Fri, 12 Jun 2026 17:29:05 Z</pubDate>
    </item>
    <item>
      <link>https://www.emploi.cea.fr/Pages/Offre/detailoffre.aspx?idOffre=40640&amp;idOrigine=502&amp;LCID=2057&amp;offerReference=2026-40640</link>
      <category>Life Sciences</category>
      <category>Fixed-term contract</category>
      <category>EVRY</category>
      <title>2026-40640 - Research engineer position in Bioinformatics </title>
      <description>&lt;b&gt;Category : &lt;/b&gt;Life Sciences&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Contract : &lt;/b&gt;Fixed-term contract&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Position description : &lt;/b&gt;&lt;br /&gt;
Since the COVID-19 pandemic, the CNRGH has also become a key contributor to the Obépine consortium, which aims to develop wastewater-based epidemiological surveillance strategies for infectious diseases. Initially focused on SARS-CoV-2, Obépine now targets the emergence of a broad spectrum of pathogens.
In this context, we are seeking a research engineer to perform the bioinformatics analysis, interpretation of high-throughput sequencing data derived from wastewater samples and implementation of innovative approaches in viral genomics.
The candidate will:
·         Implement and optimize bioinformatics pipelines for the analysis of viral genomes from complex environmental samples, in accordance with the best practices and community guidelines.
·         Process and analyze data from multiple sequencing platforms, including Oxford Nanopore, Illumina, Element Biosciences and PacBio technologies, generated by target enrichment and/or metagenomics approach.
·         Contribute to the development of robust analytical frameworks for wastewater-based surveillance. This includes the reconstruction of viral genomes, variant analysis, haplotype assignation, and the interpretation of metagenomic data from heterogeneous and noisy samples.
·         Collaborate closely with wet lab scientists to integrate experimental design and bioinformatics analysis, to provide reporting solutions to wet lab scientists, and to support the development of innovative and reliable approaches for pathogen monitoring in wastewater.
·         Contribute to conference presentations and scientific articles, and provide a thorough reporting of bioinformatics developments.
Applicants should hold a PhD or an engineering degree in bioinformatics, computational biology, applied mathematics, or a related field, and demonstrate strong experience in one or more of the following: Python, C, C++, R, or bash. Candidates should have a proven experience with next-generation sequencing data analysis, metagenomics and/or viral genomics, and strong basis of pipeline development (such as sequence alignment, genome assembly, variant calling, and metagenomics approaches). Experience in virology, environmental genomics, statistics, or phylogenetics would be a strong advantage, as well as prior experience with high-performance computing clusters.
The position requires the ability to work effectively in a multidisciplinary environment, with strong analytical thinking, scientific rigor, autonomy, and organization skills. A strong interest in continuous scientific and technological monitoring is also expected. Good written and verbal communication skills in French and English are required.&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
The candidate will:
·         Implement and optimize bioinformatics pipelines for the analysis of viral genomes from complex environmental samples, in accordance with the best practices and community guidelines.
·         Process and analyze data from multiple sequencing platforms, including Oxford Nanopore, Illumina, Element Biosciences and PacBio technologies, generated by target enrichment and/or metagenomics approach.
·         Contribute to the development of robust analytical frameworks for wastewater-based surveillance. This includes the reconstruction of viral genomes, variant analysis, haplotype assignation, and the interpretation of metagenomic data from heterogeneous and noisy samples.
·         Collaborate closely with wet lab scientists to integrate experimental design and bioinformatics analysis, to provide reporting solutions to wet lab scientists, and to support the development of innovative and reliable approaches for pathogen monitoring in wastewater.
·         Contribute to conference presentations and scientific articles, and provide a thorough reporting of bioinformatics developments.
Applicants should hold a PhD or an engineering degree in bioinformatics, computational biology, applied mathematics, or a related field, and demonstrate strong experience in one or more of the following: Python, C, C++, R, or bash. Candidates should have a proven experience with next-generation sequencing data analysis, metagenomics and/or viral genomics, and strong basis of pipeline development (such as sequence alignment, genome assembly, variant calling, and metagenomics approaches). Experience in virology, environmental genomics, statistics, or phylogenetics would be a strong advantage, as well as prior experience with high-performance computing clusters.
The position requires the ability to work effectively in a multidisciplinary environment, with strong analytical thinking, scientific rigor, autonomy, and organization skills. A strong interest in continuous scientific and technological monitoring is also expected. Good written and verbal communication skills in French and English are required.
Application
This is a 19 months position, available from September 2026. Applicants are invited to send a CV, a cover letter, and contact details for two references to the following address: gerber@cnrgh.fr.&lt;br /&gt;
&lt;b&gt;Location : &lt;/b&gt;EVRY&lt;br /&gt;
</description>
      <pubDate>Fri, 05 Jun 2026 15:07:28 Z</pubDate>
    </item>
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